鳳凰屬中亞熱帶季風濕潤性氣候，但西北中山山原卻有北亞熱帶的性質。由于西北高、東南低的地勢差異，氣候分為三種類型，第一類型是西北高寒山區（臘爾山區和山江區的北半部），海拔700米以上；第二類型是較暖區（吉信區和城郊區的南部地區）其余地區是第三類型，界于兩類之間。高寒山區和較暖區氣溫一般相差 5－6攝氏度，節氣相差15天左右。
全縣處于全國多云中心區的邊緣，年平均云量在8成以上，年平均霧日達35天，因此日照偏少，處于全國低照度中心區及湘西北低值中心區，但仍足以滿足作物正常生長的需要。
全縣處于湘西低熱區，年平均氣溫為15.9度，大于等于35度日數全年僅10.5天，日照差年平均8.3度。
鳳凰縣位于云貴高原東側少雨地區，歷年平均降雨量僅1308.1毫米，年降水量為州內最少，也是全省少雨區之一。但由于山區陰地形對暖溫氣流的阻滯和抬升作用。臘爾山區的旱情往往比城郊區為輕。
全縣冬季盛吹偏北風，夏季盛吹偏南風。所以受大氣環流的影響，表現為最明顯的季風環流。
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