飛機
日本航空公司和全日空航空公司都有航班從函館機場飛往名古屋、關系、仙臺、廣島、福岡等地因此，前往函館非常方便。
函館機場離市中心大約需要20分鐘的巴士車程。
鐵路
日間火車
從東京乘JR東北新干線旋風列車，到終點站八戶需要三個小時（座位需要預定）。之后從八戶乘坐特急列車到函館（需3小時）。
往返函館可以考慮利用日本鐵路周游券（只針對國外游客）和從北東北觀光中心到函館的雙人免費乘車券（針對一起出游的男女雙人旅游團）。
夜間火車
每晚都有幾趟從東京（上野站）到札幌的夜間火車，中途會在函館暫時停車。一般會在次日凌晨4點左右到達函館。另外，北斗星3號晚上7點從東京出發，于清晨6點到達函館，時間比較合理。從函館開出的夜間火車時間在21點和午夜出發。
日本海夜間火車在大阪/京都和函館之間每夜營運，單程旅途大約需要17 個小時。
客車
北海道中央巴士公司、道南巴士公司和北海道Kotsu 在函館和札幌之間每天營運五班日行高速公路巴士和一班夜行巴士。單程旅程需要5.5小時。
輪船
青森和函館之間有客輪開行。旅行時，可以先乘汽車或先乘火車和快速公交，然后轉乘輪船。
出租車
北海道出租車起步價650日元/4人，根據距離和時間合算車費。
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